產(chǎn)品中心
PRODUCT CENTER
發(fā)干DNA純化試劑盒
貨號 |
產(chǎn)品名稱 |
規(guī)格 |
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AD101 |
BcMag? 發(fā)干DNA純化試劑盒 |
50preps |
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AD102 |
BcMag? 發(fā)干DNA純化試劑盒 |
100preps |
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組件 |
存儲條件 |
目錄號#:AD101(50Preps) |
目錄號#:AD102(50Preps ) |
BcMag? HO-DNA Beads |
4°C |
0. 5 ml |
1.0 ml |
BcMag? Hair Pigment Removal Beads |
4°C |
0.3 ml |
0.6 ml |
1x Lysis Buffer |
4°C |
5 ml |
10 ml |
10x Binding buffer |
4°C |
1.5 ml |
3.0 ml |
1x Elution Buffer |
4°C |
0.75 ml |
1.5 ml |
Proteinase K |
-20°C |
10 mg |
20 mg |
Proteinase K Suspension Buffer |
4°C |
0.5 ml |
1.0 ml |
DTT |
-20°C |
75 mg |
150 mg |
運(yùn)輸和儲存:根據(jù)上表,在收到商品時儲存試劑盒中各組分。
使用我們的發(fā)干DNA純化試劑盒,可以快速輕松地從無根頭發(fā)樣本中提取高質(zhì)量的DNA。簡單的方案,可靠的結(jié)果和簡便的操作使其成為您無根頭發(fā)DNA提取需求的完美選擇。
簡介
頭發(fā)在法醫(yī)學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的意義
頭發(fā)是在犯罪現(xiàn)場發(fā)現(xiàn)的常見證據(jù),也是醫(yī)學(xué)研究調(diào)查中一種新的樣本類型。它在犯罪學(xué)研究中,可用于人口統(tǒng)計(jì)工作和基于DNA的分析研究。最有研究意義的DNA測序是對核DNA的短序列重復(fù)序列分析,但只有當(dāng)頭發(fā)根部和粘附組織存在時,這種研究方法才可能實(shí)現(xiàn)。
頭發(fā)在遺傳譜系中的優(yōu)勢
在法醫(yī)實(shí)驗(yàn)中,無根毛發(fā)占法醫(yī)樣品的大多數(shù)。因?yàn)轭^發(fā)本身的不溶性質(zhì),其內(nèi)儲存的DNA可以保存近百年。而且以其為樣本提取的DNA比使用骨骼和牙齒樣本提取出的DNA更不易受到微生物污染影響。值得注意的是,一根頭發(fā)就是一個單獨(dú)的生物體樣本。因此,不同樣本混合,是法醫(yī)學(xué)研究中DNA研究的一個主要障礙,因?yàn)樘峒兂龅?/span>DNA 可能不是由同一個個體頭發(fā)產(chǎn)生的DNA。
頭發(fā)的結(jié)構(gòu)及其DNA
毛囊和發(fā)干(無根發(fā)干,圖1)是可以用于提取和純化DNA的頭發(fā)的兩個部位。毛囊可以提取出細(xì)胞核DNA(nuDNA)和線粒體DNA(mtDNA)。然而,發(fā)干通常被認(rèn)為只含有線粒體DNA,可能沒有核DNA存在。但是,在犯罪現(xiàn)場采集到的頭發(fā)樣本中,無毛囊的脫落頭發(fā)可能占樣本總量的90%。這些脫落的毛干可能經(jīng)歷了角質(zhì)化、硬化和誘導(dǎo)細(xì)胞核破裂的一些列過程。但是,對于未清洗的頭發(fā),由于發(fā)干表面有組織脫落的細(xì)胞粘附在其上面,因此其具有較多的DNA可提取出,這可能是發(fā)干提取中核DNA的主要來源。盡管如此,據(jù)研究表明,在無根的毛干中仍保留一些核DNA,盡管數(shù)量很少,質(zhì)量也有很大差異。另一方面,發(fā)干中線粒體DNA也可以被完整的提純出來,用于下游應(yīng)用。
線粒體的DNA測序
人類頭發(fā)中線粒體DNA分析,可用于嫌疑人的確認(rèn)。然而,與核DNA(nuDNA)不同,個體的線粒體DNA都是遺傳自母系核酸系統(tǒng),因此缺乏選擇性潛力。除非在一些罕見的情況下,父本核酸體系中的線粒體DNA才會遺傳到子代核酸中,否則,線粒體DNA都是從母親一側(cè)繼承的。因此,線粒體基因測序無法將祖母與她的女兒或?qū)O子區(qū)分開來,只有對細(xì)胞核DNA的測序才能實(shí)現(xiàn)這種區(qū)分。但是,在調(diào)查各種毛發(fā)類樣本時,線粒體DNA測序也可以作為物種鑒定依據(jù),提供重要信息。因?yàn)椴⒎撬械拿l(fā)樣本都是屬于人類的,所以用這種方法可以識別出脫落毛發(fā)的動物。
用于短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)分型的NuDNA(核DNA)
通常,法醫(yī)實(shí)驗(yàn)室將首先會檢查頭發(fā)是否存在發(fā)根。如果樣本缺乏發(fā)根部位,法醫(yī)實(shí)驗(yàn)室通常不會對其處理或將樣本進(jìn)行線粒體DNA提取,然后做線粒體DNA(mtDNA)測序,這在歷史上被證明比用發(fā)干提取核DNA有更好的結(jié)果。但是如果發(fā)干中存在核DNA(nuDNA),則可以使用標(biāo)準(zhǔn)方法進(jìn)行犯罪嫌疑人識別,如STR分型。最近,Brandhagen等人研究發(fā)現(xiàn),盡管發(fā)干中核DNA已經(jīng)片段化,但仍可以從脫落的頭發(fā)中提取出[1]。令人驚訝的是,研究證明發(fā)干中核DNA占總DNA的大部分,這就消除了發(fā)干中只有線粒體DNA可以從無根毛發(fā)中回收的假設(shè),并證明了與線粒體DNA相比,在發(fā)干中核DNA是豐富的。因此,該研究表明了,死亡的毛發(fā)中存在細(xì)胞核DNA,但是使用傳統(tǒng)核酸提取技術(shù)無法提取出來,但是證明了,細(xì)胞核DNA是大量存在,但DNA質(zhì)量較差。
優(yōu)化毛干DNA提取工藝
DNA提取是發(fā)干法醫(yī)分析的第一步。在一根無根毛發(fā)中只能提取出皮克級別的超短DNA片段。由于實(shí)際問題和技術(shù)原因,使用不同的提取方法,優(yōu)化條件從不同樣品中,最大程度的提高收集DNA的產(chǎn)量和純度至關(guān)重要。因此,尋找一種高效、穩(wěn)定和簡單的提取DNA和擴(kuò)增nuDNA靶點(diǎn)的技術(shù)是毛干DNA提取和擴(kuò)增的主要挑戰(zhàn)。因此,研發(fā)出一種從發(fā)干中提取DNA并且能去除DNA污染的簡單方法,同時可以顯著縮短分析時間,這對法醫(yī)和人口研究是很有價(jià)值的。
BcMag? Hair Shaft DNA Purification Kit使用磁珠和優(yōu)化的脫礦質(zhì)緩沖液,被設(shè)計(jì)用于從單根頭發(fā)樣本中高效、有序地提取出總核酸。純化的基因組DNA具有最高的完整性,可用于各種下游應(yīng)用,如qPCR、STR等。
圖1脫毛色素
發(fā)干DNA純化的工作流程和結(jié)果。
1.在95°C下裂解頭發(fā)2小時。
2.添加磁珠以結(jié)合DNA。
3.清洗磁珠
4.從磁珠中洗脫DNA
參考文獻(xiàn)
1. Brandhagen MD, Loreille O, Irwin JA. Fragmented Nuclear DNA Is the Predominant Genetic Material in Human Hair Shafts. Genes. 2018 Dec;9(12):640.
2. Melton T, Holland C. Routine forensic use of the mitochondrial 12S ribosomal RNA gene for species identification. Journal of forensic sciences. 2007 Nov;52(6):1305-7.
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4. Opel KL, Fleishaker EL, Nicklas JA, Buel E, McCord BR. Evaluation and quantification of nuclear DNA from human telogen hairs. Journal of forensic sciences. 2008 Jul;53(4):853-7.
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6. Brown H, Thompson R, Murphy G, Peters D, La Rue B, King J, Montgomery AH, Carroll M, Baus J, Sinha S, Wendt FR. Development and validation of a novel multiplexed DNA analysis system, InnoTyper? 21. Forensic Science International: Genetics. 2017 Jul 1;29:80-99.
7. Brandhagen MD, Loreille O, Irwin JA. Fragmented Nuclear DNA Is the Predominant Genetic Material in Human Hair Shafts. Genes. 2018 Dec;9(12):640.
8. Parker GJ, Leppert T, Anex DS, Hilmer JK, Matsunami N, Baird L, Stevens J, Parsawar K, Durbin-Johnson BP, Rocke DM, Nelson C. Demonstration of protein-based human identification using the hair shaft proteome. PloS one. 2016 Sep 7;11(9):e0160653.